Als Schwerpunktkrankenhaus in der Kreisstadt Steinfurt verfügt das Marienhospital über elf klinische Abteilungen mit insgesamt 317 Betten. Das Marienhosiptal Steinfurt wird im Krankenhausplan des Landes Nordrhein-Westfalen geführt.

Neben den zehn Fachabteilungen wird eine Belegabteilung für Hals-, Nasen-, Ohrenheilkunde betrieben. Der Spezialisierung innerhalb der medizinischen Disziplinen wird am Marienhospital Steinfurt durch weitere besondere Schwerpunktbildungen Rechnung getragen.

Selbstverständlich arbeiten die Abteilungen interdisziplinär zusammen, um den Patienten eine umfassende medizinische Betreuung zukommen zu lassen. So wurde zum Beispiel das Gefäßzentrum von den Fachabteilugen Angiologie, Gefäßchirurgie und Radiologie gegründet. Im gastroenterologischen Zentrum arbeiten federführend die Abteilung für Gastroenterologie und die Visceralchirurgie zusammen.

Gemeinsam mit der Uniklinik Münster und dem Franziskus-Hospital in Münster hat die Abteilung für Frauenheilkunde des Marienhospital Steinfurt das Brustzentrum Münster ins Leben gerufen.